Il continente immaginario di Europa in Valkyria Chronicles è diviso e governato dall'Impero e dalla Federazione. L'ambientazione è un mondo evocativo degli anni Trenta. Per impadronirsi della ricca risorsa naturale Ragnite, l'Impero ha deciso di attaccare il principato di Gallia, che condivide i confini con le due superpotenze. Un eroe di nome Welkin è impegnato in questo conflitto, difendendo la «Squadra 7» della Milizia galliana dall'invasione e dai tentativi dell'Impero di soggiogare il continente

Le circa trenta missioni di Valkyria (comprese schermaglie non legate alla storia e missioni secondarie) sono complesse, sapientemente progettate e spesso ti mettono di fronte a sfide insormontabili e nemici unici come enormi super carri armati, nidi di mitragliatrici indistruttibili e un labirinto di mine e riflettori che dovrai manovrare mentre sei ferito. Il lavoro di squadra, il pensiero creativo e l'attenta selezione della squadra prima delle missioni sono tutti incoraggiati. Ad esempio, potresti passare tutto il tuo tempo a usare le truppe lanciarazzi Lancer per colpire un nemico forte prima di renderti conto che sarebbe meglio concentrare le tue truppe più leggere più vicine tra loro in modo che possano deporre il fuoco di supporto quando una di loro sta