Quella che era iniziata come la ricerca di un assassino diventa ben presto qualcosa di molto di più. In una storia unica parallela agli eventi del secondo film, Spider-Man scopre di non essere l'unico a rintracciare i criminali di Manhattan. La malavita è stata sconvolta da una campagna di violenza e omicidi condotta da un solo uomo che ha conquistato la città in una morsa ferrea di paura. I cattivi del film e i personaggi classici della Marvel più amati dai fan sono intrecciati in una rete intricata di azione adrenalinica, in libertà e con ragnatele, che mette i giocatori in rotta di collisione con un male ben oltre ogni immaginazione di Spider-Man