Call of Duty: Szellemek történik után katasztrofális esemény, amely megváltoztatta a globális egyensúlyát a hatalom a világon. Ennek eredményeként az Egyesült Államokat már nem ismerik el szuperhatalomként. Tíz évvel az esemény után egy láthatatlan ellenség jelent meg fenyegetésként, de az amerikai különleges erők maradékai minden ágból összegyűltek, hogy létrehozzanak egy elit katonacsoportot, a "Szellemeket", akik elhatározták, hogy felszámolnak minden fenyegetést, hogy megvédjék a gyengéket és Amerika maradványait.