Dans Prey, vous vous réveillez à bord de Talos I, une station spatiale en orbite autour de la lune en 2032. Vous êtes le sujet principal d'une expérience destinée à transformer l'humanité pour toujours, mais les choses ont terriblement mal tourné. La station spatiale a été envahie par des extraterrestres hostiles et vous êtes maintenant pourchassé