En Quake II, el escenario es de ciencia ficción.

En «Operation Alien Overlord», un intento desesperado por detener una invasión extraterrestre a la Tierra mediante un ataque preventivo contra el planeta natal de la hostil civilización Strogg, el jugador asume el papel de un infante de marina llamado Bitterman.

La mayoría de los demás soldados mueren o son capturados tan pronto como llegan a la zona de aterrizaje designada.

Bitterman sigue vivo porque se enfrentaron con otro infante de marina cuando lanzó su cápsula y se estrelló lejos de la zona de aterrizaje.

El líder de los Strogg, el Makron, es finalmente asesinado por Bitterman en su base orbital de asteroides tras abrirse paso por la metrópoli de Strogg, destruyendo puntos de referencia tácticos. Los guerreros que alguna vez lucharon solos en la Arena ahora deben unirse. Los jugadores pueden ver más secuelas.

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Características principales

• En el juego de disparos en primera persona Quake II, el jugador controla al personaje principal y participa en los disparos del enemigo.
• Si bien la velocidad de movimiento del jugador se ha reducido y el jugador ahora puede agacharse, la jugabilidad es bastante similar a la de Quake en cuanto a movimiento y controles.
• La escopeta, la superescopeta, el lanzagranadas y el lanzacohetes son las cuatro de las ocho armas de Quake que aún se encuentran en el juego, a pesar de haber sufrido cambios estéticos y modificaciones funcionales.
• El hacha, la pistola de clavos, la súper pistola de clavos y el rayo son las únicas cuatro armas que quedan de las ocho de Quake ausentes en Quake II.
• Las seis armas recién introducidas son el Blaster, la ametralladora, el Chain Gun, el Hyperblaster, el Railgun y el BFG10K.
• Quake II incluye potenciadores adicionales, como el paquete de munición, la invulnerabilidad, el bandolero, el enviro-Suit, el Rebreather y el silenciador, además del potenciador de daño cuádruple de Quake.
• Hay algunos ajustes relacionados con Quake en el juego para un jugador.
• Primero, el jugador recibe objetivos basados en misiones relacionadas con la trama, como lanzar un ataque aéreo contra un búnker y arrebatarle la cabeza a un comandante de tanque para abrir una puerta.
• Aunque todas son básicamente la misma pequeña película que muestra una imagen computarizada del personaje del jugador avanzando por las etapas del juego, las escenas CGI se utilizan para mostrar el progreso del jugador en los objetivos principales.
• Los aliados capturados por el personaje del jugador son de un tipo de personaje no hostil, otra adición.
• Sin embargo, no se puede interactuar con estos personajes, ya que todos sus captores de los Strogg los han vuelto locos.
• En comparación con Quake, los niveles del juego son significativamente más altos e incluyen mucho más espacio abierto.
• El cambio de nivel a través del sistema central es necesario para lograr varios objetivos.
• Las imágenes y los símbolos del juego comparten muchas similitudes con algunos de los de Quake.
• Tras ser dañados, los enemigos muestran signos de heridas.