Age of Wonders III, al igual que los juegos anteriores de la serie, es un juego de estrategia por turnos ambientado en un universo de alta fantasía donde el jugador asume el papel de un líder político-militar. La jugabilidad se basa en cuatro dimensiones (explorar, expandir, explotar y exterminar), donde los jugadores exploran el mapa del mundo y construyen lentamente un imperio mediante la colonización, la guerra y la diplomacia con potencias rivales. Sin embargo, la novedad de III es la incorporación de funciones de juego de rol, en las que los jugadores primero deben elegir y personalizar a su líder, todas las opciones dependen del estilo de juego elegido por el jugador. En la versión inicial hay seis razas disponibles: humanos, draconianos, elfos nobles, enanos, orcos y duendes. Todas ellas determinarán la raza de su imperio, y cada una de ellas tendrá ventajas y habilidades únicas. El líder y el imperio se moldean aún más al elegir entre conjuntos de habilidades basados en las clases de juegos de rol tradicionales, junto con otras especializaciones y habilidades para seleccionar. Cada clase líder también tiene acceso a sus propias unidades únicas con un aspecto visual distinto en función de su raza correspondiente, cada una de las cuales se adapta a su enfoque estratégico único, tanto en combate como a la hora de gestionar su imperio. En el momento del lanzamiento, un líder puede pertenecer a seis clases diferentes. La clase «Hechicero» hace hincapié en el uso de la magia para encantar e invocar unidades poderosas. El «Teócrata» proviene de una sociedad organizada basada en la religión, que incluye seguidores fanáticos y el uso de hechizos sagrados y guerreros. El «Pícaro» prefiere los enfoques menos directos de las situaciones, y emplea el sigilo, el robo y la manipulación, así como la magia negra en la diplomacia y la guerra. El «archidruida» canaliza el poder de la naturaleza y lo usa a su favor al ser muy autosuficiente y poder invocar a criaturas salvajes. El «Acorazado» lidera una sociedad de estilo steampunk, que utiliza grandes industrias, maquinaria y unidades basadas en pólvora, como cañones y tanques. Por último, el «Señor de la Guerra» se especializa en tácticas de combate y conflicto directo, y utiliza unidades y habilidades eficaces que no se basan en la magia. Los propios líderes y las unidades de héroes reclutables independientes podrán ganar experiencia y subir de nivel, además de obtener nuevos equipos y poderes. Los jugadores también pueden desarrollar su alineación entre el bien y el mal en función de las acciones de sus jugadores y de las culturas que el jugador absorba en su imperio, en lugar de competir como en los juegos anteriores de la serie. Las propias ciudades proporcionan gran parte de los recursos, la infraestructura y el lugar de acogida para la contratación de unidades. Las ciudades y unidades independientes que no estén alineadas inmediatamente con ningún jugador/líder también están presentes en el mapa mundial. Las unidades que provengan de una ciudad no afiliada lucharán por proteger el dominio de la ciudad y no olvidarán que están vinculadas a ella. Muchos de estos asentamientos independientes no son ciudades en el sentido tradicional, sino que pueden ser asentamientos alternativos, como la «Fortaleza del Gigante», por ejemplo. El jugador puede conquistar estas posesiones, que proporcionarán unidades como una ciudad, o puede absorberlas por medios diplomáticos pagando tributos y manteniendo una posición diplomática o de alineación. Fuerzas y ciudades independientes también pueden entregar misiones a los jugadores, entre las que se incluyen, entre otras, eliminar unidades salvajes, buscar reliquias e incluso conquistar ciudades y otras propiedades. Las misiones pueden conceder el apoyo de fuerzas independientes al jugador, además de una recompensa, como oro o equipo, a veces el jugador puede elegir entre una de las dos opciones al completar la misión. Como en el caso del primer juego de la serie, Age of Wonders III ofrece una campaña basada en la historia que se puede jugar desde dos bandos: el Imperio de la Commonwealth, centrado en los humanos, y la Corte de los Altos Elfos. Además de la campaña, también están disponibles escenarios para un jugador, modo multijugador en línea, generación de mapas aleatorios y un editor de mapas. Los gráficos de Age of Wonders III se presentarán en 3D en lugar de la vista isométrica que la serie ha utilizado hasta ahora.