In The Vanishing of Ethan Carter speel je als Paul Prospero, een occulte detective die een verontrustende brief van Ethan Carter ontvangt en zich realiseert dat de jongen in groot gevaar is. Wanneer Paul aankomt in Ethans huis in Red Creek Valley, realiseert hij zich dat het nog erger is dan hij zich had voorgesteld. Ethan is verdwenen na een brute moord, en Paul komt erachter dat dit misschien niet de enige moord is die wordt onderzocht. Met behulp van zowel normale als bovennatuurlijke detectivevaardigheden moet Paul uitzoeken wat er met de vermiste jongen is gebeurd.