The Metronomicon speelt zich af in een volwaardige verhaalmodus met een kleurrijke cast van helden en schurken die muzikaal sterk zijn. In The Metronomicon neem je de leiding over een groep van acht pas afgestudeerde meesters van de „ritmische gevechtskunsten” om muzikale oorlog te voeren tegen een groot aantal dansfanaten. Door in een handomdraai te schakelen tussen vier tracks die door helden worden bestuurd, kun je een breed scala aan vaardigheden en spreuken, buffs en kernwapens selecteren en activeren, waarbij je prestaties en timing van cruciaal belang zijn om ervoor te zorgen dat je bewegingen effectief zijn. In de RPG-sfeer moet je de statistieken van je personages verbeteren, op zoek gaan naar krachtige apparatuur en een groot aantal nieuw aangeleerde vaardigheden combineren. Zo nodig kun je in realtime schakelen tussen de klassen tanken, genezen, polijsten en schade toebrengen.