Het is 1962 en de Koude Oorlog heeft de natie gegrepen door angst. Een uiterst geheime overheidseenheid genaamd The Bureau begint onderzoek te doen naar een reeks mysterieuze aanvallen door een vijand die machtiger is dan het communisme. Als agent Carter heb je de touwtjes in handen, haal je de trekker over en leid je team in een aangrijpende tactische third-person shooter die zich afspeelt in een geheime oorlog om de mensheid te beschermen tegen een buitenaardse vijand.