A Quantum Conundrumban, a játékosok egy fiatal gyerek szerepét vállalják, aki a nagybátyja küszöbén esett le a hétvégére; nagybátyja éppen így történik, hogy zseniális, különc feltaláló, Fitz Quadwrangle professzor. Amikor belépett a professzor hatalmas kastélyába, amelyet őrült technológiával felszereltek, hogy teszteljék legújabb hipotéziseit, a játékosok gyorsan rájönnek, hogy nagybátyjuk eltűnt. Szerencsére a játékosok hamarosan hozzáférhetnek Quadwrangle professzor legújabb találmányához, az Inter-Dimenzionális Shift Device-hez, amely egy gombnyomásra teljesen új dimenzióba tolja a körülöttük lévő világot. Annak érdekében, hogy megtalálják, a játékosoknak az újonnan talált IDS eszközt kell használniuk, hogy dinamikusan megváltoztassák a világot különféle dimenziókba és onnan, hogy haladjanak a bonyolult Quadwrangle Manoron keresztül.. Utazás közben, A különféle dimenziók kihasználásában ügyessé válás segít nekik az egyik bizarr és kihívást jelentő helyiségből a másikba utazni. Lehet, hogy elég könnyűnek hangzik, de ez egy magas rend egy gyerek számára egy kastély óriási rejtvényében