Het is een mystieke fantasiewereld met weelderig groen, uitgestrekte vlaktes, torenhoge bergen — en donkere ruimteschepen. Yep. Hoewel het een typische wereld van zwaarden en magie lijkt, voegt End of Eternity buitenaardse invasies toe aan de mix, waardoor zowel mensen als dieren worden bedorven en er harteloze metalmonsters van worden gemaakt. Daryon, de roodharige held van de game, gaat eropuit om te ontsnappen aan de aanvallen van zijn eigen soort en waagt zich door Heryon op zoek naar een manier om zijn wereld te redden en gaandeweg zichzelf te definiëren. Maar het lijkt erop dat de Crystals een ander plan in gedachten hebben...